Passado. Há cerca de 20 anos atrás, uma entidade de inteligência artificial, chamada de MCP (Master Control Program) ameaçou tomar conta de um mundo desavisado sobre sua ameaça.
Somente Kevin Flynn, um gênio da computação, pode ficar entre a entidade e o resto da humanidade. Digitalizado e inserido em um fantástico universo digital, Flynn é a única esperança da raça humana, mas para isso deverá combater e vencer diversos programas em seus próprios jogos e mundos. E ele realmente o faz, com a ajuda de um programa de segurança chamado Tron.
Presente. 20 anos depois do "incidente", Alan Bradley, criador do programa Tron original, finalmente replicou a tecnologia utilizada para digitalizar um ser humano, e permitir que ele seja inserido em computadores. O segredo do processo reside em Ma3a, um programa sofisticado o suficiente para manter dentro de sua memória a completa composição genética de um ser humano, bem como a correção e algoritmos necessários para restaurar um ser humano em perigo, e trazê-lo de volta ao mundo físico.
A empresa de Alan está a beira de uma mega fusão com a Future Control Industries (fCon) que, infelizmente, não tem as mais honestas idéias de uso da tecnologia por ele, e pretende colocar hackers especialmente treinados dentro das maiores redes digitais do mundo.
Descubra o que acontece, e como será o futuro, neste jogo inspirado pelo filme clássico de 1982.